Здравствуйте!
Если квартира  муниципальная, значит, вы с отцом занимаете ее по договору социального найма. В соответствии со ст. 80 Жилищного Кодекса РФ "Наниматель  жилого помещения  по договору социального найма и проживающие совместно с ним  члены его семьи  по взаимному согласию  и  с предварительным  уведомлением  наймодателя вправе  разрешить безвозмездное проживание  в занимаемом ими жилом помещении  по договору социального найма  другим гражданам  в качестве  временно  проживающих (временных жильцов). Наймодатель вправе  запретить  проживание  временных жильцов в случае, если после их вселения  общая площадь  соответствующего жилого помещения  на каждого  проживающего составит  для отдельной квартиры менее  учетной нормы". Я так полагаю, что по этому основанию (недостаток площади вашей квартиры для вселения)  вам и отказали во вселении. Т.к. если бы квартира была в вашей собсвенности, то при временном вселении метраж квартиры не учитывался бы.